В связи с этим процесс ее познания подразделяют на следующие временные этапы: предварительная ориентация в хозяйственной деятельности, раскрытие содержания предмета анализа, описание предмета анализа и формирование выводов и предложений по результатам анализа. Перечисленные этапы охватывают действия по восприятию явлений деятельности учреждений, последовательному их изучению, рассмотрению их сущности и обобщению результатов. Во-вторых, метод анализа хозяйственной деятельности бюджетных и научных учреждений характеризуется различными подходами к рассмотрению объектов анализа. Они позволяют применять определенные математические, статистические и другие процедуры (приемы). Так, при анализе деятельности учреждений исходят из того, что экономические явления, хозяйственные процессы и показатели изучаются по одному с учетом временной и условной их изоляции от других.
Это обеспечивает соблюдения принципа выделения главного звена и конкретизации результатов изучения. Одновременно исходят из того правила, что для глубокого и всестороннего изучения отдельные явления хозяйственной деятельности должны рассматриваться вместе с теми явлениями, с которыми они находятся в тесной связи и зависимости. Такой подход необходим для выявления и измерения степени воздействия факторов их изменения.